Мухаммад Нафаа родился 12 мая 1952 года в друзской деревне Бейт-Джан. Начальное образование он получил в родной деревне, а среднее образование — в средней школе в деревне Рама, где добился успехов в учебе.

В мае 1970 года он поступил на службу в Армию обороны Израиля и был направлен в Пограничную службу. С самого начала своей службы он выделялся природными лидерскими качествами и, успешно окончив курс подготовки командиров, был направлен на курсы командиров отделений и командиров рот, где добился выдающихся успехов. Позже он служил инструктором по набору новобранцев на учебной базе Пограничной службы и дослужился до должности старшего сержанта роты.

Во время службы он женился на Назиме, и в 1972 году у них родился первый сын, Рами. За эти годы у Мохаммеда и его жены родилось ещё пятеро детей: Сами, Самия, Рания, Салех и Ноэль.

После окончания срочной службы в мае 1973 года он добровольно поступил на срочную службу и служил в различных оперативных подразделениях. В 1977 году он был зачислен в 21-ю роту, а с началом Галилейской мирной войны его подразделение было переброшено на оперативную службу в Ливан. Командиры ценили его как преданного, тихого и скромного командира, который руководит своими подчиненными и служит им личным примером.

Помимо военной службы, Мухаммед увлекался оружием и стрельбой. Он был известен как выдающийся стрелок и состоял в стрелковой команде Пограничной охраны, с которой участвовал во многих соревнованиях и занимал призовые места. Другим его любимым хобби была охота, в которой он проявил себя как талантливый и меткий.

4 ноября 1983 года, во время Галилейской мирной войны, автомобиль, начиненный взрывчаткой, проник в здание пограничной полиции в городе Тир и взорвался. Начинка составляла около полутонны. В результате атаки, известной как «Вторая тирская катастрофа», погибло около шестидесяти человек, в том числе двадцать восемь сотрудников служб безопасности. Среди них был старший сержант Мухаммад Нафа.

Мухаммед умер в возрасте 31 года. Он был похоронен на семейном участке кладбища Бейт-Джан, оставив после себя жену и шестерых детей.

В своей хвалебной речи его командиры сказали: «Пройдёт много времени, прежде чем мы сможем свыкнуться с тем, что Мухаммад Нафаа покинул нас. Его имя было известно ещё до него, как лучшего бомбардира Северной пограничной охраны. Он с честью представлял Пограничную охрану и выиграл множество чемпионатов».

Память о Мухаммеде увековечена в доме Яд Лабаним, в Мемориале мучеников-друзов в Усфии и в Мемориале мучеников в Бейт-Джане.